1、进一步完善新企业所得税法实施条例中关于不征税收入的表述
明确企业的不征税收入用于与取得应税收入有关的支出所形成的费用或者财产，不得扣除或者计算对应的折旧、摊销扣除。
2、明确工薪扣除标准
（1）制订与新税法相配套的《工资扣除管理办法》，以便操作规范并准确把握政策。
（2）对工薪“合理性”制订量化指标。比如，日本所得税法对企业前几位董事兼股东的工资薪金水平有明确限制，规定不得超过全体雇员平均工资的一定水平；美国对工资薪金支出合理性的判断提出了具体的指标要求。
（3）对企业股东以工资名义分配利润或经营者不适当地为自己开支高工资，以达到在计税时多扣除目的的，可按照“推定股息”理念对其不合理工薪推定为股息分配，计入应纳税所得额。
（4）对“职工”构成的要件进行限定，以增加纳税人造假的成本和风险责任。对于依照劳动合同法的有关规定，不签订书面用工合同或协议，或者虽签订了合同、协议，但未经国家有关部门鉴证的，规定其所支付的工资、薪金不得在税前扣除。对未按照国家的有关规定为职工缴纳基本养老保险等基本保险的，所支付的工资、薪金不得在税前扣除等。
3、弥合新税法与新会计准则的差异，明确福利费扣除衔接方法
笔者建议，2008年在规定比例内实际发生的职工福利费支出，先在2007年末职工福利费计提结余额中列支，到计提结余额使用为零以后，再按新税法规定的比例据实在应纳税所得额中扣除。
4、进一步明确原税制下几个税前扣除项目的过渡衔接问题
如2006年年底前已作纳税调增的工挂结余、已提取的职工教育经费的结余及已做纳税调增的投资损失等，应当进一步明确其过渡衔接的问题。
（三）加紧制订优惠政策享受条件及审批制度
1、加快与新税法优惠配套的相关政策的出台
（1）尽快明确原有优惠政策的时效性和有效性。如对原享受优惠政策未到期的，如主辅分离优惠政策、国产设备投资抵免优惠政策以及新出台的文化体制改革试点地区优惠政策的执行时效问题等，需尽快加以明确。
（2）区分轻重缓急，针对目前新税法的工作重点和难点，以及急需解决和明确的有关事项，尽快出台相关优惠判定标准，以便于基层在操作时有章可循。如，研发费用列支范围和“开发新技术、新产品、新工艺”的认定和管理办法；制订《环境保护专用设备企业所得税优惠目录》、《节能节水专用设备企业所得税优惠目录》和《安全生产专用设备企业所得税优惠目录》等。
2、明确税收优惠审批制度
对哪些税收优惠属于审批类、哪些属于备案类，权限、程序如何履行，表证单书、提供资料如何确定等具体问题应系统化地重新加以明确。新税法及其实施条例对减免税做出调整，但相关新企业所得税减免税的具体优惠管理办法尚未出台。企业在季度申报中，哪些可以直接享受、哪些需要审批、审批的程序等，应尽快明确。
3、增设《购置专用设备投资抵免企业所得税明细表》
因为涉及跨期结转抵免及专用设备持续使用监管问题，需要税务机关在连续的几个纳税期内进行跟踪管理，管理难度相对较大。为提高管理质量和效率，笔者建议在年度纳税申报中增设《购置专用设备投资抵免企业所得税明细表》作为附表，对该类抵免进行全面、连续的登记管理。
（四）加强新企业所得税征收管理
1、限定核定征收纳税人的范围
本着既保护真正的小规模纳税人利益，又要有效防止纳税人以不设置账簿实行核定征收而骗取税收优惠的原则，将可以享受税收优惠的核定征收纳税人的范围进行限定。即对经税务机关批准不设置账簿而实行核定征收的纳税人方可享受相关税收优惠政策，同时对可以不设置账簿的纳税人的规模作出明确界定。除此之外的应设置而不设置账簿的纳税人，不得享受国家的所有税收优惠政策。
2、细化企业清算所得税征管
新税法实施后，应当细化企业清算所得税征管规定，明确企业向税务机关申请注销时应提供哪些资料，计算清算所得时对企业资产的可变现价值或者交易价格该由谁认定、如何认定、清算所得的计算公式如何确定等问题，以利于加强管理，防止税收流失。
