新税法第五十五条规定：企业应当在办理注销登记前，就其清算所得向税务机关申报并依法缴纳企业所得税。新企业所得税法实施条例第十一条规定：清算所得是指企业的全部资产可变现价值或者交易价格减除资产净值、清算费用以及相关税费等后的余额。笔者认为，从1994年以来，由于没有对企业清算进行明确的征管规定，大部分企业注销时没有向税务机关提交清算报告，实际上税务机关很难对企业清算所得进行管理，企业注销时税收流失比较严重。
二、进一步完善新企业所得税法规体系的建议
（一）完善总分机构企业所得税计税及征管体系
1、细化计税办法
（1）进一步加强对分支机构利用组织结构变化避税的监督，明确、细化对二级分支机构及二级以下分支机构作出判定的适用标准，统一各地税务机关征管口径。可采用的指标及依据包括：分支机构经营权限；业务范围；企业内部的组织架构层级等。
（2）制订专门的建筑安装、房地产类企业总分机构税收管理配套制度，按照法人所得税制原则，由总机构统一汇总缴纳企业所得税，同时，加强对外经营环节的管理，提高总机构对挂靠项目的财务核算的监管。
（3）对加盟店、挂靠单位、承包地分支机构等特殊分支机构，应明确凡其具有独立生产经营权、在财务上独立核算并定期向总机构上缴租金或者承包费的，应当就其生产、经营收入和所得纳税，并接受税务管理。
（4）对所有跨地区经营未实行就地预缴的分支机构实行年度纳税反馈制度，凡是未能提供已在总机构统一纳税证明的，由分支机构所在地主管税务机关就地补征税款，以避免由分支机构非法人化而导致的税收流失。
2、理顺总分机构企业所得税征管关系
（1）借新税法实施之机，应尽快理顺总机构与分支机构的税收征管关系，对非法人分支机构进行一次清理，重新明确所得税征管权限，以保证总机构与非法人分支机构的主管税务机关一致。同时，将税务登记表按法人与非法人分支机构作进一步区分。
（2）从制度层面上加强非法人分支机构税收管理，建立全国总分支机构信息网络平台和联合评税制度，实现纳税人户籍及申报等数据信息的动态共享，减少漏征漏管户的出现。在确保信息安全的基础上，大力推行电子申报、网上申报，借助金税三期工程，完善综合征管软件的企业所得税应用管理功能，特别是结合新税法中新的管理内容与要求，增加如业务招待费、公益捐助、广告费、涉税事项审批等管理功能。借鉴以往企业所得税管理经验，特别是纳税评估信息的分析与应用，在企业所得税信息化建设中应统一规范国、地税企业所得税的管理内容，实现国、地税企业所得税管理信息的共享，以信息化促进同一地区不同管理机关在新税法实施过程中政策把握的一致性，为纳税人提供一个公平的税收环境。
（3）建立信息的反馈制度和总局的协调监督机构，实行年度纳税申报表双向申报复核备案制度，各地出现的问题亦由当地税务机关反馈到监督机构裁决。
（4）尽快开发涵盖企业所得税管理各个环节的企业所得税信息化综合管理系统，通过开发纳税评估软件，设置各指标关系和预警指标，对录入数据进行分析、比对，及时发现纳税申报中存在的问题，为税务机关开展纳税评估、税务稽查打基础。通过推进企业所得税管理信息化建设，力争所得税纳税申报、数据采集一致，从而实现资料信息共享，全面提高企业所得税管理水平。
