以往，建设项目审计大多为事后审计，这虽然也能发挥监督作用，但由于“秋后算账”的滞后性和间接性，使其威慑力打了折扣。秋后算账并不是审计的目的，及时解决问题才是关键。即便查出了问题、惩办了有关责任人，但损失业已造成，再想追回或弥补都相当困难。而跟踪审计则不同，项目建设全过程参与、全过程跟踪，能够更好地解决问题，充分发挥审计的监督作用。跟踪审计已在汶川地震灾后恢复重建工作中初露锋芒，发挥了巨大的作用。在抗震救灾阶段，各级审计机关对抗震救灾资金和物资开展了跟踪审计，有效地保障了救灾款物的合理合规、公开透明使用。现在，由抗震救灾阶段转入了灾后全面恢复重建阶段，审计继续发挥着重要作用。
审计署2008至2012年审计工作发展规划中要求审计机关积极探索跟踪审计方式，要对关系国计民生的特大型投资项目、特殊资源开发与环境保护事项、重大突发性公共事项、国家重大政策措施的执行试行全过程跟踪审计。近来，跟踪审计作为审计部门加大建设项目审计监督力度、探索投资绩效审计的一种有效方式，已广泛开展。审计署陆续对汶川地震灾后恢复重建、北京奥运场馆、西气东输二线等建设项目进行跟踪审计，地方各级审计机关也积极对本辖区内的建设项目进行跟踪审计。
建设项目有投资大、周期长、涉及领域广、可变因素多等特点，如何把握审计重点则是跟踪审计的关键点，也是难点。以下分三种情况对建设项目跟踪审计的重点把握提出粗浅的看法：
一、重大突发性项目
灾后恢复重建属重大突发性建设项目，灾后重建不仅关系到灾区人民千家万户的切身利益，社会各界高度重视和关注，而且社会敏感度极高。再则，时间非常紧迫。灾后恢复重建跟踪审计工作量很大、项目很多，而且非常分散，可以说是千头万绪。很多项目直接关系到老百姓的居所问题和生产、生活问题，时间不等人。这类建设项目的跟踪审计对审计重点的把握提出了很高的要求，只有把握住重点，才能抓住主要问题，才能保障恢复重建。
首先要定目标。灾后恢复重建跟踪审计的目标就是：促进灾后恢复重建的顺利进行，保障灾后恢复重建不出重大问题。也就是说通过审计，发现和处理一些制度障碍和管理不规范等问题，促进其很快得到解决，推动灾后重建工作的顺利进行。制度障碍问题，比如：援建资金拨付迟缓影响工程建设顺利进行，工程建设项目缺乏有力的项目管理制度等，审计应该提出来促进整改，避免由于制度障碍导致的重大问题；重大问题，比如：重大的违法违规问题、重大的损失浪费问题，重大的资源破坏问题，重大的质量事故问题，重大的耕地破坏、毁损、非法占用，甚至倒卖等问题，这些问题应该及时得到解决、查处、纠正和整改。
然后再抓重点。第一是重点领域。首要的是民生工程，其次是重要的、涉及到民众切身利益的公共设施。比如说学校、医院、桥梁；第二是重点内容。一是总体规划和灾后恢复重建的相关政策贯彻落实情况以及贯彻落实中出现的新情况、新问题；二是灾后恢复重建资金分配、管理和使用情况；三是灾后恢复重建工程项目质量管理状况；四是灾后恢复重建过程中生态环境保护、资源利用状况；五是灾后恢复重建中，土地特别是耕地的保护利用情况；第三是重点项目。有些项目是民生工程，资金量也很大，就要抓住不放；有些项目虽然不直接关系民生，但投资量大，也一定要抓住；有些项目是社会高度关注的，同样一定要抓住。
总之，我们在灾后恢复重建跟踪审计中要定好目标，切实做到全面跟踪，抓住重点。
二、特大型投资项目
随着经济的发展，建设项目的规模越来越大。其中特大型建设项目已成为领导关心、百姓关注的重点，各级领导要求审计机关能事前加入，全程跟踪，及时提供有关信息，为领导决策提供依据。如北京奥运场馆、西气东输二线等特大型投资项目，投资额巨大，项目信息处理工作量庞大，工程建设的社会影响深远，搞好跟踪审计的重要性不言而喻。
