一、建设项目跟踪审计的原则
工程项目建设是一个由多方参与的综合性活动，需要各项目参加者相互配合协调，使各项工作形成合力，确保项目建设顺利进行。因此，在开展跟踪审计工作时，必须明确工作目标，合理定位。开展工程跟踪审计工作应遵循下列原则：一是服从项目总体建设目标。工程项目建设目标包括进度、功能(质量)和投资，跟踪审计时必须明确具体要求，围绕工程项目建设目标开展工作，同时加强对各建设目标分析和评价，做好各建设目标的平衡与优化。二是以投资控制为中心。建设项目审计的主要目标是控制投资，因此在进行跟踪审计时应紧紧围绕这个中心开展工作，监督建设资金的运用、投资的控制情况，同时，应用价值工程理论，对设计方案和施工方案进行优化，提出合理化建议，以最大限度地发挥投资效益。
二、建设项目跟踪审计的质量控制
(一)跟踪审计的事前控制建设项目跟踪审计机构的组建。审计部门参与工程建设全过程跟踪审计时，应派出专职审计人员进驻施工现场，专人专职负责对建设项目全过程全方位的跟踪监督与管理。审计人员应由造价审计人员、财务审计人员和工程技术人员组成。通过招标选定咨询单位并派专业人员进驻施工现场，组建临时审计办公室，实施跟踪审计。临时审计办公室在审计处派出人员的领导下开展工作。社会咨询单位应无条件地服从工程建设的需要，积极配合建设单位的工作。审计部门应加强对社会咨询单位的指导、监督和管理，定期检查其工作情况，汇总、反映并协调跟踪审计过程中出现的矛盾和问题，制定审计方案。依据项目特征、可行性报告、概(预)算文件、年度预算安排情况、建设资金筹措计划、有关工程核算管理制度等制定相应的跟踪审计方案。审计人员的工作要点、主要内容以及相关部门需要提供的审计资料在审计方案里都应做出明确规定。这样，审计人员在工作中可对照审计方案检查自己的工作是否做得完整、到位，有无疏忽遗漏。工程项目建设是一项综合性强的技术经济活动，涉及的部门和人员多，每个建设项目都是经过设计、施工、监理、建设管理部门等单位共同努力完成。因此，在开展跟踪审计工作之前，加强与相关职能部门的沟通十分必要。同时，正确处理好与基建管理、财务等相关部门的协调配合关系，明确各自职责和权限。
(二)跟踪审计的事中控制跟踪审计的目的是规范管理，有效控制工程项目投资。审计工作必须紧紧围绕经济活动这个核心，项目实施过程中有关造价的环节是跟踪审计的重点。因此，跟踪审计应集中力量抓好以下几个重要环节：
工程项目设计阶段。在项目做出投资决策之后，控制项目投资的关键就在于设计，设计阶段影响投资的因素很多，其中设计标准、设计方案、结构安全系数等都对工程造价影响很大。设计阶段的跟踪审计工作目标是确定设计单位资质是否符合规定，设计的深度和质量是否满足要求，设计是否控制在工程项目计划投资额内，设计是否达到限额设计要求。
招投标阶段。审查工程量清单并参与标底答疑。现行的工程量清单招标实行量价分离，量的风险由甲方承担，因此审计人员应根据招标文件及图纸要求审查工程量清单是否完整、准确，以减少结算中因量的变化带来造价的增减。审查招标文件并全过程参与工程招标。对于招标文件主要审查其招标范围是否完整；文字表达是否准确；评标办法是否科学；程序是否合法。审计人员参与招标过程，便于对评标过程全面的了解，特别是商务标部分，出现超低或超高价，审计人员应对这些“超常价”进行对比分析，找出原因。在评标过程中，施工单位的现场答疑及承诺，审计人员应要求以书面形式记录备案，一旦其中标，将写进合同条款
