事业单位当年实现的结余，按规定可进行分配。事业单位应设置“结余分配”科目，下设“应交所得税”和“提取专用基金”等明细科目，核算当年结余分配情况。被限定用途的结余，应按限定用途转入相应的基金账户，未被限定用途的结余转入事业基金。根据规定事业单位专项结余不参与结余分配。
（一）结余转入结余分配
年度终了，将“事业结余”和“经营结余”科目的余额转入“结余分配”科目，会计分录如下：
借：事业结余
经营结余
贷：结余分配——未分配结余——事业结余
结余分配——未分配结余——经营结余
（二）结余进行分配
事业单位当年实现的结余（不含专项结余），应当按下列程序进行分配：一是有所得税缴纳业务的事业单位计算应交所得税；二是按核定比例提取职工福利基金。
会计分录如下：
（1）根据税法规定，属应纳税所得，按规定的税率计算缴纳应交所得税。
计提时，
借：结余分配——应交所得税
贷：应交税金——应交所得税
解交时，
借：应交税金——应交所得税
贷：银行存款
（2）按财政部门核定的比例提取职工福利基金。
借：结余分配一提取职工福利基金
贷：专用基金——职工福利基金
