该项财政资金在计算企业所得税时已经从所得额中减除，上述不征税收入用于支出所形成的费用或形成的资产计算折旧、摊销时，若再在纳税所得额中扣除就会获得双重优惠，这是不允许的。财税[2009]87号规定，据实施条例第二十八条的规定，上述不征税收入用于支出所形成的费用，不得在计算应纳税所得额时扣除；用于支出所形成的资产，其计算的折旧、摊销不得在计算应纳税所得额时扣除。
注意5年内未发生支出且未缴回要重新计入收入总额，根据财税[2009]87号规定，企业将符合本通知第一条规定条件的财政性资金作不征税收入处理后，在5年（60个月）内未发生支出且未缴回财政或其他拨付资金的政府部门的部分，应重新计入取得该资金第六年的收入总额；重新计入收入总额的财政性资金发生的支出，允许在计算应纳税所得额时扣除。
上述两条若企业忽视了处理或处理不当，不但要补税、缴纳滞纳金，还将面临50%至5倍的罚款。
五、分类进行会计处理
1.国家投资，应当作为权益，计入并增加企业实收资本或股本，借记银行存款，贷记实收资本或股本。
2.资金使用后要求返还的本金，会计处理应当作为负债，计入借款或其他应付款处理，借记银行存款，贷记借款或其他应付款。
3.企业取得的除上述两种情况之外的其他财政资金，会计处理作为损益，原来有计入补贴收入的，现在全部计入当期营业外收入，借记银行存款，贷记营业外收入。
此外，为准确把握“财政性资金”的内涵，应关注以下几方面：1.企业取得的来源于政府及其有关部门的资金都是财政性资金，不局限于财政拨款的单一形式；2.直接减免应并入应税收入的只有增值税，其他税种的直接减免额不并入应税收入；3.即征即退、先征后退、先征后返属于税收优惠的具体形式，即由税务部门先足额征收，然后由税务部门或财政部门退还已征的全部或部分。只要是享有此类形式优惠的所有税种，均应计入企业当年收入总额；4.出口退税款不并入收入总额，因为出口退税退的是上一个环节的进项税，是企业购进货物已负担的部分，不是本环节实现的税收；5.某些地方政府为促进地区经济发展，采取各种财政补贴等变相“减免税”形式给予企业优惠，均应计入企业当年的应税收入。6.“乱收费”项目不得税前扣除。
案例实析
湖北省某县一制造企业2009年发生5种与财政性资金有关的业务：1.从地方政府借款1000万元，需要按期付息，并在5年后还本；2.企业取得的属于三废资源综合利用的200万元增值税退税款；3.地方某职能部门要求支付10万元“集资建学费”，依据是县政府的文件；4.取得了地方政府用于帮助企业发展、购置固定资产、不需要偿还的财政支持资金280万元；5.取得了由国务院财政、税务主管部门规定专项用途，并经国务院批准的财政性资金160万元。
