建设管理阶段，审计时应着重关注招投标、政府采购、工程监理和合同管理等方面的内容。建设单位是否严格按招投标法实行招标，是保证项目公开透明关键一步。和其他政府投资项目一样，招投标是工程建设项目中违法违纪问题最多的地方，审计应着重关注。对于已列入政府采购目录的产品，是否严格执行政府采购，必须关注。关注工程监理情况，监理单位资质是否满足要求，人员情况配备、素质是否能够胜任，监理工作记录是评价监理工作的重要依据。作为电子政务建设项目，与传统的建设项目相比，电子政务建设有其特殊性，电子政务建设项目技术含量高，专业化程度高，技术发展迅速，各种软硬件价格变化较快，客观上增加了项目监管的难度，审计过程中结合具体情况，着重关注项目形成的文档，对比项目申报审批阶段初步设计方法和投资概算等文档，有偏离情况重点审查。审查合同签订内容，严格禁止层层转包。关于建设管理阶段审计，和其它政府投资项目审计相似，投资审计的案例也比较多，这里不再详述。对于自行组织开发的项目，源代码及相关的文档非常重要，系统以后的更新维护离不开这些文档。笔者曾见过一些企业，以源代码和文档为要挟，继续要求从事与之相关的后继项目，（因其他单位根本无法介入，这样势必造成巨大浪费。）使一些项目成为一些企业的寄生虫。也有因为其它企业不能继承前项目，导致后继项目无法公开招标，形成行业垄断。为以后的高收费做铺垫。对于这部分，签订合同异常重要，一定要明确。对于这部分的审计，应该关注那些隐性的腐败。同时，对于已经造成损失的，或者是变相造成行业垄断，审计应该予以揭露。
4、验收审计
系统建设完成后，验收必不可少。电子政务项目技术含量高，建设单位由于人员、技术、设备等原因，自行组织验收困难较大。很多单位往往是在实际运行中发现问题，才带出了项目质量问题。对于项目验收的审计，应关注验收的程序，审核项目形成的资产。如前所述，电子政务建设形成的无形资产较多，价值难以评估，可行的办法是严格核对项目主管单位在项目开工前的批复，抓住差异较大的地方不放，审计要追根求源，揭露事实。
5、运维阶段审计。电子政务项目投入运营后，后期的运行经费数目不小。一些电子政务项目，后期运维经费由于缺乏相关制约，运维费的随意性很大，今天软件做个小的修补，动则几万甚至几十万，更有甚者打着运维费的名义，开展新的项目。同时如果运维费大大低于正常水平，也可以辅证系统基本没有使用，项目是“形象工程”可能性较大。这个阶段应从审查运维制度入手，查看相关运维单位责任是否明确、实施流程是否规范、运维服务质量能否得到保证。审核运维资金使用流程，跟踪运维资金使用去向。关注运维资金预算执行情况。
三、电子政务工程建设项目审计未来发展
中国的电子政务是从上世纪80年代的办公自动化开始, 历经“ 金税、金关、金卡工程” 、“ 十二金”工程和政府上网工程等进程。2002 年《国家信息化领导小组关于我国电子政务建设指导意见》出台，2006年《2006——2020年国家信息化发展战略》公布，这些意见和规划在促进政府信息化的同时，也带来信息化投资的迅速增加。2009年2月，电子信息产业促进规划获原则通过，必将进一步促进政府信息化投资，在强调构建“高效、廉洁、透明”政府时，审计机关对政府信息化投资必定会更加关注，然而，由于电子政务其特殊性，目前国内没有成熟绩效评价体系，相关的法律和法规有待建设和完善等原因，政府大规模开展专项电子政务投资审计条件不是很成熟，建议审计是从财务收支入手（如文章开头提到的审计署在对国土资源部预算执行审计时发现电子政务建设问题那那样），关注电子政务建设过程中资金流向，逐步向评价电子政务绩效过度，促进政府提高资金使用效益，发挥审计监督作用。
