主要表现在：一是管理理念同现代化的税收征管方式不相适应。一些人，特别是一些基层领导，在管理理念上同现代化的税收管理方式不相适应，产生了手工论、专管论等思想。
二是税收管理员的素质不能够完全适应当前税收征管工作的要求，特别是信息化发展的要求，有的税收管理员至今不能够独立操作综合征管软件和税收管理员系统等相关应用系统，需要靠手工的方式统计各种数据、查看纸质报表等。
三是税收管理员职责界定不尽合理，重复工作较多。
四是税收管理员工作量不平衡，畸轻畸重，缺乏激励机制。调查中发现，有的税收管理员管理二三百户，有的仅管理十几户；有的税收管理员月份最高调查核实、巡查、评估等任务数达到120户次，有的税收管理员月份任务仅为几户次，这种工作量上的畸轻畸重挫伤了部分税收管理员的工作积极性，同时由于缺乏绩效考核和激励机制，造成部分税收管理员缺乏责任感，影响了工作的质量和效率。
五是税收管理员存在很大的执法风险。由于税收管理员是税收征管的重要抓手和载体，人数众多，并且有相关的管户责任，必然会带来“管户责任”的执法风险。而一些行政执法的监督部门在监督税收行政执法过程中，也以此为依据，追究税收管理员的行政执法责任。
笔者认为应从以下几个方面完善税收管理员制度。
一、对税收管理员的职责进行梳理，进一步明确税收管理员的职责。
根据“管户与管事相结合”的原则，将税收管理员由“管户”为主的管理方式，向“管户”和“管事”相结合转变。“管户”要了解纳税人的动态信息，掌握企业的“活情况”。具体的职责包括日常巡查及采集涉税信息资料、责令纳税人依法办理各类涉税事项，进行违法违章行政处罚的调查和执行、送达有关税务文书、税收保全或强制执行等税收管理措施的执行等。结合税收管理员管理信息系统的应用，细化日常巡查、调查等内容。“管事”要管理一般性事务工作，具体职责主要包括纳税人申请的涉税事项的调查核实和税务机关安排事项的调查、日常检查、上级交办的其他工作任务等。
二、明确划分税收管理员与办税服务厅人员、综合管理人员、稽查人员的职责。
以“纳税人找税务机关的事项到办税服务厅办理，税务机关找纳税人的事项由税收管理员办理”为原则，将税务机关的行政行为分成依申请的行为和依职权的行为，纳税人申请事项的受理或办理由办税服务厅人员负责，税务机关依照职权进行主动管理的行为由税收管理员负责；明确划分税收管理员与基层综合管理部门的职责，税收管理员根据基层法规、税政、征管等综合部门的安排，到纳税人实际生产经营地进行调查核实等直接面向纳税人的管理工作，综合管理部门根据税收管理员的调查结果作出审批决定或加强管理的措施；明确划分税收管理员与税务稽查人员的职责，阐明日常检查和稽查的关系，明确征管移交的条件、环节和反馈方式等。
三、梳理重复、存在税收执法风险等工作事项。
在明确划分职责的基础上，对税收管理员职责进行梳理，取消税收管理员不必做的、重复做的工作，如受理文书、重复调查等；对税收管理员存在执业风险的工作，如申报表签字、发票验旧等，进行梳理和规范；对多数税收管理员不会做的，也就是税收管理员能力不及的工作，如纳税评估、汇算清缴检查等，将其从税收管理员职责中剥离出来，实行专业化管理。
加强税源管理，充分发挥税收管理员的能动作用，只靠税收管理员制度是不够的，需要建立与税收管理员制度相衔接的管理机制以及信息化的支撑，来保障税收管理员制度的实施。
