设置会计核算科目时考虑预算项目。把财务核算与财务预算联系起来。高校会计核算科目与预算项目不对应，主要是会计核算明细科目分类要求很细，而预算管理要求科目只分大类，没有细化到具体预算管理项目。会计信息资料与预算编制没有对应，难以满足高校预算管理的要求，给高校拨款、资金管理、预算执行情况分析等带来不便。同时，预算和决算还存在差异，会计核算时，会计科目能根据具体情况进行适当调整。保证年度财务会计核算资料与预算决算项目一致。
三是可比性原则要求
加入权责发生制更能反映会计信息质量。为使高校会计制度能更好地适应高校日趋发展的新形势，建议将“收付实现制为基础的会计核算”修正为“根据实际情况把权责发生制和收付实现制两种会计核算基础结合的核算制度”。用权责发生制弥补收付实现制的不足，用以适应高校核算和管理需要。如收缴学费、基建融资利息的核算等采用权责发生制。且高校后勤和产业财务管理核算采用权责发生制，在学校财务合并后勤和产业财务账目时，理论依据更充足，也可准确反映高校的债权债务。有利于高校对资产的持续经营，加强负债管理。两种核算基础相结合的模式，可准确反映学校净资产、客观体现高校的资产负债情况，从而提供高质量会计信息。
四是专款专用原则要求
加强科研费用管理。财政部和教育部于2009年8月5日（财教[2009]173号）颁布《中央高校基本科研业务费专项资金管理暂行办法》规定：“使用基本科研业务费形成的固定资产、无形资产等按照国家有关规定纳入高校资产管理范嗣，合理使用，认真维护；高校要建立健全责任制，项目负责人对经费使用和项目实践的合理性和有效性负责，学校、科研管理部门等按职责承担相应责任；高校基本科研业务费用项目实施情况。要自觉接受财政、教育、监察等部门的监督检查，及时纠正存在的问题。”详细操作办法暂未颁布，但高校应按每个科研项目进行收支管理，严格管理资产和费用。目前对于科研经费的开支，大部分都较随意。管理不严。建议在核算科研费用时，将每一项目所有费用进行明细分类，某项科研形成的固定资产也单独核算。 该项日结题后，委托有关部门对浚项目进行合理、合法性审核，出具项日审计结论。避免经费随意开支，保证科研形成资产的完整性。
（三）改进会计核算具体管理办法
第一，合理核算高校每一批毕业生培养成本。首先，将学校每年与学生关系密切的支出分成两部分，一部分是可以直接记人学生培养成本的费用，直接记人某系某专业学生培养成本；另一部分是不能直接记入学生培养成本的费用，但与培养学生有密切联系的费用，可设置科目如“培养费用”归集，通过某种费用分配方法，分配到某系某专业学生的培养成本中。其次。在每年年末。将汇集到某系某专业的学生费用，在本专业毕业生和在校生之间进行分配。计算出每批毕业生的直接培养成本，井计算出每一位毕业生的平均直接培养成本。最后，把支出的其他费用（高校的除学生培养费用以外的支出）平均分配到每一个毕业生的培养成本上。再将学生在校期间的所有费用汇总，计算出每一位学生的培养成本，即学生在校期间学校的平均费用支出。此数据可以作为学生学费的根据，也可以作为上级拨款的依据。同时，还可以将各项直接费用和间接费用作横向、纵向比较，及时发现各项龆用开支是否合理，促使各高校注意节约成本，提高管理和服务效益。
第二，关于“会汁报告”称谓。反映事业单位财务状况和收支情况的书面文件如何称谓，也是事业单位会计改革需要考虑的问题。笔者认为应将“会计报表”改为“会计报告”。原因是：首先，由于事业单位会计面临的环境日趋复杂化，人们对会计信息的需求范围、内容也不断变化，从以往单纯的数量信息向数量与文字信息并重方向发展，从单纯货币信息向货币与非货币信息改进。单一的会计报表无法容纳大龄文字、非货币信息。其次，从我国目前情况看，要求会计报表与会计报表附注、财务情况说明书同时提供。单一的会计报表容易引起误解。再次，我国《会计法》和《企业会计制度》及有关会汁规章制度。也已将原来使用的“会计报表”一词改为“财务会计报告”，可见，将“会计报表”一词改为“会计报告”有利于事业单位会计制度与其他会计规范的协调一致。
第三，关于多渠道多方式筹集资金在报表中列示。高校筹集资金多渠道多方式，民营资金和外部资金参与高校建设和运行后，高校的财务管理应该将这部分资金的使用和结余情况按照企业的要求和规定进行核算，使得外部投资者通过报表和相关资料，能理解高校整体财务运行情况，包括资产负债、收入支出和现金流动情况，也便于其他渠道的资金能够更多地进人高校，使高校更好更快地发展。
第四，应重视现金流量信息，增加现金流量表。事业单位是否需要编制现金流量表，这是在企业编制现金流量表后，会计界不少学者提出的问题。虽然事业单位现金流量信息重要程度不及企业。但笔者认为事业单位也有必要编制现金流量表：首先，编制现金流量表有助于会计信息使用者对事业单位现金流入、流出进行分析、利用，以掌握事业单位现金增减变动状况。其次，事业单位定期编制货币资金收支计划，也就有必要编制反映这种计划执行情况的货币资金收支情况表（即现金流量表）。最后，事业单位也需要掌握货币资金的运用和支付能力。避免出现资金紧缺不能支付到期应付款项的情况。事业单位编制现金流量表不能完全套用《企业会计制度》中现金的概念，也不一定将表中的现金流量分为经营活动、投资活动和筹资活动三类，可以简化处理。编制现金流量表对于事业单位内部和外部了解其现金变化状况十分必要。
