2010年中央一号文件将继续加大对农业农村的投入力度，完善农业补贴制度，让亿万农民在就业、社保、教育等农村社会事业领域享有更多福祉。“三农”问题始终是关系党和人民事业发展的全局性和根本性问题，建设社会主义新农村是全社会的共同任务，也是审计机关责无旁贷的任务。审计机关应切实增强为新农村建设的责任感和使命感，对被审计单位或部门以及其他经济组织履行其职责时所管理和使用的涉农资金的情况进行审查与评价，在社会主义新农村建设中充分发挥好职能作用。
一、加强涉农资金审计的必要性
1.财政支农资金的增加及其涉及面的扩大的需要
随着社会主义新农村建设的全面开展，国家财政支农资金逐年增加，国债和预算内资金用于农村建设的比重也在加大，由于涉农资金点多面广，资金来源渠道多，资金链条粗而长；涉农单位众多，不仅涉及到各行业各领域。涉及到众多部门，且涉及到千家万户，情况复杂，如何保障政府各种专项资金落到实处，并发挥效益，真正使农民得到实惠，让农民放心，必须加大对涉农专项资金、农村集体经济收入的审计监督，强化涉农资金审计。
2.可以运用审计绩效理论对涉农资金进行深入剖析，强化了对农村管理部门的审计
对涉农资金进行审计可对涉农资金的管理与使用情况等方面进行深入剖析，检查其效益水平，评价和分析影响整体效益的因素，寻找提高其效益的途径，促进相关部门正确决策、科学管理、提高涉农资金的管理水平和使用效能，维护资产安全，以最小的投入获得最佳的效果。同时对涉农资金审计可以加强对农村管理部门的审计监督，促进农村管理部门党政领导干部增强新农村建设的责任感和使命感，确保财政支农资金真正落到实处并发挥效益。
3.是对涉农政策执行情况的审计和调查
进行涉农资金审计，是围绕农村社会养老保险、征地农民补偿、社会救助、新型农村合作医疗等一系列事关农村改革发展稳定的重点和热点问题开展审计和审计调查，在一定程度上促进了农村社会养老保险基金的管理，清欠了征地农民的补偿费，促进了农村卫生政策的落实和完善，提高了农民合作医疗保障水平，为切实维护农民利益发挥了一定的重要作用。
4.是加强对涉农专项资金审计的需要
通过涉农资金审计和审计调查，分析、反映、揭示了不同地区存在的困难和问题，为促进政府有关部门建立健全项目决策制度，加强资金管理，按时保质完成项目建设，促进加快农业产业化进程和提高农业科技含量，确保提高资金使用效益发挥了一定的作用。同时，为加强对涉农专项资金的实时监控，部分地区还利用计算机联网对有关科技兴农资金管理使用情况进行跟踪和远程审计，为进一步实现对科技兴农资金的实时监督创造了一定的条件。
5.强化了对涉农基础设施建设项目的审计
为促进新农村基础设施建设，部分审计机关重点对项目预算和竣工决算进行审计，探索建设项目跟踪审计，核减工程投资，节省建设资金，保证涉农基础设施建设顺利进行。如关注农村水利灌溉、农村公路、小流域治理等基础设施建设情况，查处改变和挪用项目资金、虚报冒领、损失浪费、工程质量低劣等问题；且针对审计中发现的问题，向有关部门提出相关改进建议，以确保相关惠农利民的措施落到实处。
二、当前涉农专项资金存在主要问题
农业专项资金分配使用管理中存在一些问题，已经严重影响了农业资金的使用效益，影响了政策的执行效果。主要表现在以下方面：
1.涉农资金被闲置
有些涉农资金常年挂账，未实际发生支出，影响了资金的使用效益。对实际形成闲置的涉农资金，应限期收回，重新进行安排和分配。
2.涉农资金被迟延
财政拨付涉农资金不及时，资金主要集中在第三、第四季度拨付，往往在年底形成大量的结余，未及时拨付到实施项目上，导致年度资金结转数额较大，影响了年度预算的执行效果。
