国发[2007]40号规定，2008年1月1日（含）之后完成登记注册在深圳、珠海、汕头、厦门和海南经济特区上海浦东新区内在的国家需要重点扶持的高新技术企业，在经济特区和上海浦东新区内取得的所得，自取得第一笔生产经营收入所属纳税年度起，可享受二免三减半（25%的减半）的优惠税率的优惠政策。
目前的问题是，由于〈办法〉规定高新技术企业为在中国境内（不包括港、澳、台地区）注册一年以上的居民企业，因此，如果企业在2008年取得第一笔收入，由于其成立未满一年，2008年无法认定为高新企业，若2009年被认定为高新企业，但企业也只能在2009年享受最后一年的免税政策。
关注核心自主知识产权
根据国家知识产权局在2006年统计数据显示，我国99%的企业没有申请知识产权，申请了知识产权的企业只有0.17%有发明专利。因此，中国目前很多企业并不拥有核心自主知识产权。办法规定，企业与他人签订5年以上的在全球范围内独占该项许可权利的方式取得知识产权的独占许可，可以达到认定需要的条件。值得注意的是，由于代表企业核心竞争力的核心技术和发明专利几乎被国外企业垄断，申请者要取得全球范围内的独占许可权当前具有一定的困难，一些此前打擦边球的企业将失去高新技术企业的资格。
需要注意的是，企业拥有自主知识产权，是以取得版权或者著作权证书为准。而且“近三年”是指申报当年以前的连续三年（不含申报当年）用于的知识产权，即2008年申请的企业知识产权必须是2005、2006、2007年取得的，2008年取得的证书不计算在内，而只能等到2009年申请时计入。
注重研发费用规划使用
《办法》和《指引》对符合条件的研究开发费用范围进行了界定与列举。企业应按照财企[2007]194号《关于企业加强研发费用财务管理的若干意见》规定进行研发费用的归集，同时按照办法及指引中所确定的研发费用的硬性指标，做好研发费用的预算和规划。根据上述规定，我们认为，企业有必要建立一个完善的会计核算体系或者改进现有的会计核算系统，以便能够准确记录并按项目、类型对研发费用进行归集，以符合办法和《指引》的要求。另外，今后研发费的归集最好单独设立科目，便于将来审计。
指引中明确了以下3类工作人员属于符合要求的研发人员：研究人员、技术人员以及辅助人员。除了办法所规定的研发人员占企业当年职工总数要达到一定比例外。指引还强调，研发人员应是与企业签订了劳动合同并累计实际工作时间在183天以上的人员。
须要注意的是，企业的人员测算可以参考人事统计的方法，由企业自己填报。建议企业加强在人力资源方面的管理，因为工作内容描述、考勤表以及年度绩效考核、劳动合同等资料，是申请高新技术企业资格时证明符合研发人员要求的强有力的支持材料，企业的人力资源部门应当可以提供这样的信息记录。
