二是问责方式不严谨。按照《中华人民共和国审计法》的规定，目前审计问责大致有三种方式：
1、通过审计决定直接提出处理处罚意见；
2、移交纪检监察、司法机关处理；
3、责成被审计单位自行纠正处理；
上述处理方式空间非常大，没有刚性的数额要求，审计处理时随意性较大，仅仅凭借执法者的良心和原则去处理。
三是问责机制不畅通。《中华人民共和国预算法》制订于1994年，全法共11章79条，规定非常笼统，法律责任没有细化。对于一般性预算调整未纳入预算法调整范围，地方预算缺乏刚性，年年都有调整，而这些调整大都未依法进行，擅自调整预算行为普遍。因此，即使查出了违反《预算法》的问题，也因“法不责众”，不了了之。
四是问责意识不强。目前审计机关，特别是基层审计机关，大都存在问责意识不强的问题。造成这一问题的主要原因，既有主观上的不愿得罪人，怕失“选票”等方面的原因，更重要的一点是客观原因造成的，这就是基层审计机关经费不足的问题相当突出，对查出的问题想问责而不愿问责，倒不如收几个罚款，增加审计机关经费（即使是收支两条线，但与财政部门也有返还比例）。
四、审计问责的出路
（一）明确问责主体。近日发布的《关于实行党政领导干部问责的暂行规定》第三章“实行问责的程序”明确提出：“对党政领导干部实行问责，按照干部管理权限进行。纪检监察机关、组织人事部门按照管理权限履行本规定的有关职责”。由此可以得出结论，行政问责的主体是纪检、监察机关和组织人事部门，并非审计机关。那么作为审计问责，可以说只是行政问责的一个部分，这就需要我们审计机关在问责问题上有一个正确态度。即既是问责主体又不是问责主体，既要问责又不能完全担当问责角色的问责工作，一是要严格审计执法，依法依规处理审计查出的违纪违规问题；二是要增加审计工作透明度，对违纪违规问题在不影响国家和商业机密前提下公开审计结果，同时更重要的是要公开处理及整改结果；三是不能越俎代庖，需要提请相关部门问责的，按规定移送处理。
（二）明确问责内容。除《中华人民共和国审计法》和《财政违法行为处罚处分条例》规定外，在审计问责时我们还要关注以下两个法律内容：一是《关于实行党政领导干部问责的暂行规定》第二章第五条“决策严重失误，造成重大损失或者恶劣影响的”属于问责内容之一；二是《中华人民共和国行政许可法》第七十五条：“行政机关实施行政许可，擅自收费或者不按照法定项目的标准收费的，由其上级行政机关或者监察机关责令退还非法收取的费；对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予行政处分。截留、挪用、私分或者变相私分实施行政许可依法收取的费用的，予以追缴；对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予行政处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。”。
上述问题，在审计工作中应该经常遇到，对这类问题除作经济上的处理处罚外，还应该提请问责实施部门实施问责。
（三）完善问责机制。一是要解决审计与问责脱节问题。我们的审计不是一有问题就处理人，但不处理人，我们的审计很难维护国家财经法纪，这些年，为什么有些问题“屡查屡犯”，这既有法制不健全、财政体制不规范方面的原因，一个重要原因，可能在于我们的审计与问责没有很好结合起来。因此，既要审计问题，也要追究责任。二是要发挥“审计免疫功能作用”。审计就是根据国家政治制度中设计的定位与职责，预防、揭示和抵御国家经济运行中影响国家利益的问题，查出了问题就要要求整改，如果整改到位了，说明我们的问责也就到位了。因此，督促审计整改是审计工作的一个重要部分。三是积极主动的做好行政问责配角。近年来，审计机关先后与纪检、监察、公安、检察院分别联合制发了联合办案制度、这些制度的建立，为审计问责提供了一个很好的平台，审计机关要认真落实《关于实行党政领导干部问责的暂行规定》，对审计中查出的问题，就必须积极主动地办好移送处理和督促落实工作
