（一）不注重定性指标分析
现行财务报表对表内信息确认的标准过于苛刻，财务指标都从财务报表内计算得来，使得相当一部分非货币化、不确定的、难以定量化的信息被排斥在报表体系之外，而这些非定量化的信息已经越来越能够反映企业经营中面临的问题，对企业来说越来越重要。这是导致现行财务报表体系局限性的一个重要原因。
（二）缺少反映无形资产的指标
在对企业进行财务分析时，忽视了企业另一项重要资产——无形资产的作用。企业在分析偿债能力、盈利能力等时，并没有考虑无形资产对企业的影响。这对一些无形资产在总资产占很大比重的企业来说，分析的结果并不可靠，往往会给信息使用者带来错误的信息。
（三）财务风险指标亟待完善
目前，我国企业普遍采用的财务风险指标主要依靠偿债能力指标、营运能力指标和盈利能力指标这些指标构建。因此具有一定的局限性。主要体现为：目前的财务风险分析指标几乎都局限于资产负债表和利润表，对于最易反映潜在危机信号的现金流量状况缺乏分析；金融工具的不断创新以及外部环境的不断变化给现行的财务风险指标带来强烈冲击。因此，企业要想在激烈的、充满风险的竞争环境中取得突破，必须完善现行的财务风险指标。
（四）非财务指标没有得到体现
非财务指标是指基于财务报表以外的、更广泛的企业信息基础上的指标。财务指标反映的只是去年的绩效，并不能提供创造未来价值的动因，非财务指标则面向未来，其改善往往需要管理层付出多年的努力，同时一旦上述指标顺利完成，将明显改善公司财务业绩。非财务指标是体现管理层绩效和公司发展前景的更好指示器。然而，由于发展的不均衡，我国在非财务指标的研究和利用方面与国外还有很大的差距。在传统的财务指标体系越来越不能满足企业发展需要的情况下，建立非财务指标体系已经越来越有必要。
（五）行业标准选择的局限性
工业发达国家如美国、日本的一些政府和金融机构，定期公布各行业财务方面的统计指标，甚至同行业企业的工会与个别公司的信用部门，也搜集产业平均财务比率的资料。我国目前虽然一些官方机构和报刊提供了部分行业的财务数据，但往往行业划分较粗，抽样误差较大，缺乏一定的代表性。同时，随着越来越多的企业采用多元化经营，其经营跨及许多行业，没有明确的行业归属，给行业分类带来了困难，也使得同业对比更为困难。
三、企业财务指标的改进措施
（一）重视定性指标和无形资产指标
引入定性指标，全面完善财务指标的系统性。如引入可持续发展指标，可增强企业的社会责任感和发展的可持续性，在尽可能减少环境污染、降低社会成本的基础上，实现最合理的利润；引入智力指标，智力资本对企业的生存和发展起着至关重要的作用。同时，企业的无形资产是企业通过长期的经营管理和技术创新形成的重要资源和宝贵财富，衡量企业无形资产、知识资本价值的指标应为重要的财务指标，这样才能真正地衡量企业的持久生命力。对于一些公认的，对企业影响很大的无形资产，在对企业进行财务分析时应当予以考虑。这对于经营者实现企业的财务目标和利益相关者做出正确的决策具有积极的作用。
