国家从1999年实施退耕还林以后，又陆续出台了一系列惠农政策。其中：直接补贴给农民的资金除退耕还林资金以外，还有粮食直接补贴、农作物（水稻、玉米、小麦、棉花）良种补贴、能繁母猪补贴、农资综合直补、农机具购置补贴、油菜补贴、汽车家电下乡等补贴资金。按政策规定，这些资金都必须由乡镇财政部门直接发放给农户，2006年以前大多数乡镇以现金方式发放给农民，2006年以后，基本上以“一折通”形式发放，但少数偏远乡镇，仍有部分补贴资金以现金方式发放。由于惠农补贴资金种类多，范围广，而且涉及多个年度。审计人员面对一大撂一大撂的补贴花名册，要么不知从何如手，要么工作效率低，事倍功半。笔者总结了四种审计方法供同行们参考。
一是逆查法。一个乡镇一种补贴资金，少则几千户，多则几万户；一个乡镇一个年度内所有补贴资金，少则二三百万元，多则五六百万元。财政部门往往采取组织专班集中兑现的办法，但由于近几年农村举家外出务工人员较多，集中兑现后总有一部分尾欠，只能陆续兑现到农户手中。财政部门会分阶段结出尾欠，并做好账务处理。审计人员可从最后一次结尾欠记账时入手，一步一步的往前查，核对前后的尾欠花名册是否能衔接上，金额是否相符等，这种方法既便于迅速掌握惠农补贴资金兑现的整个情况，提高工作效率，又可从中发现漏洞。笔者在审计中就发现某乡镇财经所惠农补贴资金会计在结尾欠时欠仔细，认为尾欠花名册只要达到90%准确就行了，登记掉了的农户找上门了再补上去，其实这是一种严重不负责任的态度。如果漏记的农户不找上门来，就可能造成资金的流失。
二是盘点法。即对惠农补贴资金会计结存资金或存折进行突击盘点，看实际结存资金或存折是否与账面结存数相符，是否与尾欠花名册的结存数相符。这种方法主要是看财经所（单位或个人）有无拉扯惠农补贴资金的行为，是否公款私存，未发放的存折是否妥善保管。
三是筛选法。即从电子表格中筛选出有疑点的农户。一是补贴数量较大的，如退耕还林、粮食补贴大于10亩的，能繁母猪超过4头的等等；二是重名多了的。这种方法主要是便于下一步走访调查，看有无虚报冒领，有无重复领取。
四是走访调查法。这种方法是审计惠农补贴资金常用的方法，即抽查一部分农户（筛选出的补贴大户首当其中），审计人员深入到农户家中，调查了解各项补贴资金的落实情况，包括是否公示，是否由财政部门发放，是否知道补贴标准等等，并查看补贴凭证、存折及农民负担监督卡，与补贴花名册核对，看是否相符。这种方法主要是了解乡镇执行惠农政策的情况，有无弄虚作假套取资金，农户是“一折通”还是“多折通”，资金是否一分不少的到达个人账户。
