新企业所得税法实施后，财政部、国家税务总局陆续下发了若干文件，对企业所得税优惠政策执行中出现的有关问题作了明确。正确理解文件精神，对于企业依法充分享受现行所得税优惠政策尤为重要。笔者认为，以下几个问题尤其需要引起相关企业关注：
根据财税[2008]21号文，对按照国发[2007]39号文有关规定适用15%企业所得税率并享受企业所得税定期减半优惠过渡的企业，应一律按照国发[2007]39号文件第一条第二款规定的过渡税率计算的应纳税额实行减半征税。即2008年按18%税率计算的应纳税额实行减半征税，2009年按20%税率计算的应纳税额实行减半征税，2010年按22%税率计算的应纳税额实行减半征税，2011年按24%税率计算的应纳税额实行减半征税，2012年及以后年度按25%税率计算的应纳税额实行减半征税。
新税法实施后，有关文件也规定了若干定期减免税的优惠政策。如根据财税[2008]1号文，我国境内新办软件生产企业和集成电路生产企业经认定后，自获利年度起，第一年和第二年免征企业所得税，第三年至第五年减半征收企业所得税。如果这类企业又被认定为高新技术企业而享受减按15%的税率征收企业所得税，那么其在定期减免期内是否可以按15%减半后的7.5%税率征收所得税呢？财税[2009]69号文明确，除国发[2007]39号文规定的过渡优惠政策及西部大开发优惠政策的企业，其他各类情形的定期减免税，均应按照企业所得税25%的法定税率计算的应纳税额减半征税。
优惠政策不得叠加
国发[2007]39号文规定，企业所得税过渡优惠政策与企业所得税法及其实施条例中规定的优惠政策存在交叉的，由企业选择最优惠的政策执行，且一经选择，不得改变。
企业所得税法及其实施条例根据“产业优惠为主，区域优惠为辅”的原则，规定了若干形式的优惠政策，除所得税定期减免外，还有诸如计算应纳税所得额时减计收入、研发费用及安置特殊就业人员人工费用加计扣除、技术转让所得减免所得税、购置环境保护等专用设备按一定比例抵扣应纳税额等等，这些优惠政策与过渡优惠政策是否也不能叠加享受呢？
财税[2009]69号文明确，这里所称的“不得叠加享受”，只限于企业所得税过渡优惠政策与企业所得税法及其实施条例中规定的定期减免税和减低税率类的税收优惠。企业所得税法及其实施条例中规定的各项税收优惠，凡企业符合规定条件的，可以同时享受。对此纳税人应予以关注，以免不能充分享受税法规定的各项优惠政策。
分支机构适用政策
新税法以是否具有法人资格作为企业所得税纳税人的认定标准。而“两税”合一前，内资企业以是否独立核算而非是否具有法人资格为纳税人认定标准，外资企业虽以法人作为纳税主体，但对其在我国境内从事产品生产、商品贸易、服务等业务的分支机构，其生产经营所得应适用该分支机构所在地同类业务企业适用的企业所得税税率。也就是说，“两税”合一前，不具备法人资格的内、外资企业分机机构，都可能单独享受所得税优惠政策。
根据税法第57条规定，在新税法公布之日即2007年3月16日之前设立的企业，可以享受过渡性税收优惠政策，那么企业在2007年3月16日之前设立的分支机构，是否可以单独享受国发[2007]39号规定的企业所得税过渡优惠政策呢？
对此，财税[2009]69号文明确，单独依据原内、外资企业所得税法的优惠规定已享受有关税收优惠的分支机构，凡符合国发[2007]39号所列政策条件的，都可以单独享受国发[2007]39号规定的企业所得税过渡优惠政策。当然这里需要注意，新所得税法实施后规定的有关优惠政策，作为不具备法人资格的分支机构是不能单独享受的。
