编制合并会计报表
编制合并会计报表是会计工作中的难中之重。主要表现为：首先需要准确判断应该纳入合并的企业范围。其次是合并分录的编制，合并分录必须进行全面编制。具体包括：编制合并资产负债表和利润表时进行的母、子公司及子公司间长期股权投资与所有者权益及相应的长期股权投资减值准备的抵销；债权、债务项目及相关坏账准备或相关减值准备间的相互抵销；销售商品（或提供劳务）或其他方式形成的存货、固定资产、工程物资、在建工程和无形资产等所包含的未实现内部销售损益及对这部分资产计提的跌价准备或减值准备；投资收益与发行方利息费用的抵销；投资收益之间的抵销；其他内部交易的抵销等；还包括编制合并现金流量表时，母、子公司间及子公司相互之间当期以现金投资或收购股权增加的投资所产生的现金流量的抵销；当期取得投资收益时收到的现金与分配股利、利润或偿付利息支付的现金的相互抵销；以现金结算债权与债务所产生的现金流量的抵销；当期销售商品所产生的现金流量的抵销；处置固定资产、无形资产和其他长期资产收回的现金净额与购建固定资产、无形资产和其他长期资产支付的现金的相互抵销；当期发生的其他内部交易所产生的现金流量的抵销。
需要注意的是，在购买日抵销时产生的差额的处理中，要区分同一控制下的企业合并和非同一控制下的企业合并两种不同企业合并类型进行不同的处理。如在同一控制下的企业合并中，长期股权投资的初始投资成本与所发行股份的面值总额之间的差额，一般应当调整资本公积；资本公积不足冲减的，调整留存收益。非同一控制下的企业合并中，长期股权投资与所有者权益抵销的差额应计入商誉、债券投资与应付债券抵销的差额应计入投资收益项目。
金融资产的处理
新会计准则将金融资产根据性质划分为以下4类：以公允价值计量且其变动计入当期损益的金融资产，包括交易性金融资产和指定为以公允价值计量且其变动计入当期损益的金融资产；持有至到期投资；贷款和应收款项；可供出售金融资产。这4类金融资产划分条件各不相同，会计处理也大相径庭。其中交易性金融资产相关业务的处理要点包括：首先，交易性金融资产的初始计量和后续计量都要采取公允价值，且这种计价方式不能改变；其次，初始确认的相关交易费用要直 接计入当期的“投资收益”项目；再次，后续计量时，交易性金融资产因公允价值变动形成的利得或损失，应计入“当期损益—公允价值变动损益”。
持有至到期投资核算的难点需与交易性金融资产相区分：首先，持有至到期投资的后续计量不采用公允价值计价方式，而是采用实际利率法，按摊余成本计量，实际利率应当在取得持有至到期投资时确定，在该持有至到期投资预期存续期间或适用的更短期间内保持不变；其次，持有至到期投资在持有期间应当按照摊余成本和实际利率计算确认利息收入，计入投资收益；再次，持有至到期投资的交易费用应当计入初始确认金额，资产负债表日有客观证据表明该持有至到期投资发生减值的，应当计提减值准备。
可供出售金融资产核算的难点是在资产负债表日，可供出售金融资产应当以公允价值计量，且公允价值变动计入“资本公积”（其他资本公积）；而处置可供出售金融资产时，在将取得的价款与该金融资产账面价值之间的差额，计入“投资损益”的同时，还要将原直接计入所有者权益的公允价值变动累计额对应处置部分的金额转出，计入“投资损益”。
公允价值变动损益的核算
该业务相关核算的困难之处在于其涉及范围比较广，包括企业交易性金融资产、交易性金融负债以及采用公允价值模式计量的投资性房地产、衍生工具、套期保值业务等公允价值变动形成的应计入当期损益的利得或损失。在以上涉及的业务中，其后续计量都需要计算公允价值变动损益，由于在资产负债表日，对这些资产按照公允价值计价的过程中，某些资产公允价值的确定比较困难，从而使得公允价值损益的金额确定也存在一定问题。
预计负债的处理
处理的主要难点来源于与之相依存的或有事项的不确定性。其涉及的企业对外提供担保、未决诉讼、产品质量保证、重组义务、亏损性合同等事项，普遍存在履行该项不确定性义务使企业经济利益流出的预计只是一个具有估计性质的可能性值，需要根据这个可能性估计一个最佳预计负债金额，而这个金额又在一定程度上依存于与之相关的或有事项的有关风险、不确定性和货币时间价值等因素的估计和确认，使得预计负债的数值确定困难。
