上述事项可能涉及增值税进项税的处理，除此之外，应付账款一般不直接涉及税收事项。但必须注意的是，企业购入材料、商品或者接受供应单位提供劳务的真实性和准确性会影响到税款的正确性，同时也影响到应付账款的真实性和准确性。
案例：某检查组到一家国有甲公司例行检查，查前分析各项税负正常。进入该企业后，检查组又对各项数据指标和账面核算情况进行了仔细分析和检查。当检查到应付账款科目时，检查员小张觉得该科目年报余额很小且与税收关联度不大，本想一带而过，但打开账页后，发现多数账户所欠账款的时间一般均在一个月以内，且不是按每笔发生额支付就是定期结清欠款，但唯独应付运费的账户不同。应付运费科目中，每个月贷方发生额仅有2万～3万元且不是按每笔或按期结清欠款，而是每月支付1~2次，每次支付2万~3万元的整数现金，但从未结清过余额，这引起了小张的注意。为了摸清情况，小张决定来个统计分析。他针对贷方和借方的发生情况分别设计了一张统计表。对贷方设计的内容有：运输单位、运送起始点、运送货物、运输数量、运输时间、运输合同号、运费金额、双方经办人等。对借方设计的内容有：收款单位名称、付款日期、付款方式、付款金额、双方经办人等。花了半天时间填完表格后，小张发现了甲公司存在没有运输合同、运输发票内容填写不全、无法查明每笔运费发生的实际情况3个问题。由于无运输合同及发票的内容填写不齐全，由此也无法判断甲公司运输行为的真实性和运费金额的合理性。另外，发票上开票人的姓名虽是同一人，但笔迹明显是两人所为。
小张意识到甲公司支付的运费可能有假，他请甲公司财务部邱经理将与运费对应的相关购进入库或销售的货物找出来，但邱经理磨磨蹭蹭才找到两份会计凭证。小张将发现的问题和疑点告知了邱经理。在事实面前，邱经理承认了所有问题。原来，甲公司有一家固定的运输户，只要甲公司的车来不及运输，就请该运输户帮忙。该运输户每次都给甲公司多开发票。后来，甲公司还让该运输户开具了不少空头发票。最后的检查结果是，甲公司在3年的时间里共虚报运费43万元，不仅抵扣了7%的增值税，而且扣除增值税后的余额都计入了成本或费用。最后，甲公司受到了应有的处罚。
分析类似上述案例中甲公司的问题并不少见，发现该问题也并不复杂。检查人员能够先从“应付账款——运费”账户的核算中发现异常，然后设计汇总表进行统计分析，最后根据汇总表的结果发现疑点和问题，这就看出了检查人员丰富的经验。在上述案例中，甲公司在3年时间里共虚报运费43万元，但由于对其增值税和所得税的税负并未造成很大影响，因此，按照常规分析方法，并不能发现税负偏低的问题。由此可见，检查人员不仅要善于从同类账户中分析并发现其中异常账户的疑点和问题，而且还要不怕麻烦，在必要时学会运用对同类事项进行汇总、统计及对比分析，这样，一些问题自然就会暴露出来。
